本所图书馆筹建于1980年，经过40年的积累，现有藏书5万余册，其中外文图书、港台图书6千余册。藏书以宗教学研究资料为主，辅以哲学、美学、民族学、历史学、文学、社会学类图书资料；收藏学术期刊10多种。

图书馆现有6个分馆：

1号馆（文科楼140室）主要庋藏宗教学、哲学、美学、民族学、历史学、文学、社会学类单册本学术著作；

2号馆（文科楼157室）主要庋藏道教、佛教、民间宗教大型文献和基本古籍。

3号馆（文科楼219室）主要庋藏地方志、档案、碑刻、金石、史学大型文献，以及卿希泰先生著述作品、基督教研究文献资料等。

4号馆（文科楼123室）主要庋藏港台出版的宗教文献、文学大型文献、宗教研究系列丛书，以及学位论文、学术期刊（过刊）等。

5号馆（文科楼169室）主要庋藏线装古籍。

6号馆（文科楼152室）主要庋藏日文、英文等外文文献。